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四川大學(xué)華西醫(yī)院生物治療國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/腎病研究室邵振華研究員團(tuán)隊(duì):大麻素受體CB1與別構(gòu)調(diào)節(jié)劑配體識(shí)別的分子機(jī)制

四川大學(xué)華西醫(yī)院生物治療國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/腎病研究室邵振華研究員團(tuán)隊(duì)于2019年11月在“Nature Chemical Biology”(影響因子12.15)發(fā)表文章"Structure of an allosteric modulator bound to the CB1 cannabinoid receptor"(長(zhǎng)按下方二維碼即可閱讀全文)。




大麻素受體CB1屬于GPCR(G蛋白偶聯(lián)受體)Class A類家族,在人類神經(jīng)系統(tǒng)中高度表達(dá),大麻素類藥物通過(guò)激活該類受體進(jìn)而調(diào)節(jié)體內(nèi)的生理反應(yīng)。CB1受體主要分布于中樞神經(jīng)系統(tǒng)中,是疼痛、癲癇、肥胖癥、抑郁癥、肝纖維化或多發(fā)性硬化癥的治療靶點(diǎn)。CB1的激動(dòng)劑和拮抗劑配體識(shí)別受體的正位位點(diǎn),分別調(diào)節(jié)信號(hào)通路的開(kāi)和關(guān)。除了正位配體外(激動(dòng)劑和拮抗劑),其別構(gòu)調(diào)節(jié)劑不僅影響大麻素類激動(dòng)劑的結(jié)合,而且同樣具有調(diào)節(jié)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的能力。理解別構(gòu)調(diào)節(jié)劑的分子機(jī)制將有助于我們更好地理解GPCR信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的復(fù)雜機(jī)理。


CB1的別構(gòu)調(diào)控分子最早在2005年由Price等人報(bào)道。他們發(fā)現(xiàn)化合物ORG27569不僅能增強(qiáng)CB1的正向激動(dòng)劑CP55940的結(jié)合,更有趣的是,該化合物抑制了下游Gi 蛋白的信號(hào)途徑。為了更好地理解ORG27569作為CB1受體負(fù)向別構(gòu)調(diào)節(jié)劑(NAM)的分子機(jī)理,我們用X射線晶體學(xué)的方法解析了CB1受體-激動(dòng)劑CP55940-ORG27569三元復(fù)合物的三維結(jié)構(gòu),為該類受體的新型藥物開(kāi)發(fā)和篩選提供了新的思路。



圖1 CB1配體的二維結(jié)構(gòu) (a)THC,(b)CBD,(c)CP55940和(d)ORG27569


從我們獲得的CB1與激動(dòng)劑和NAM的三元復(fù)合物整體結(jié)構(gòu)來(lái)看,CP55940占據(jù)正位結(jié)合位點(diǎn),而ORG27569結(jié)合至膜內(nèi)的螺旋外位點(diǎn)(圖2a,b),主要與受體的TM4互作,并且沿著面向脂質(zhì)的疏水表面延伸以接觸TM2(圖2b)。CB1在G蛋白結(jié)合位點(diǎn)處于非活性構(gòu)象(圖2c),TM5和TM6向核心區(qū)域位移,從而導(dǎo)致識(shí)別和結(jié)合G蛋白的區(qū)域大幅度減少。這就解釋了CB1受體在激動(dòng)劑作用下,ORG27569抑制Gi信號(hào)通路的原因。



圖2 CB1結(jié)合CP55940和ORG27569的整體結(jié)構(gòu)  (a)從膜平面內(nèi)觀看,CB1(藍(lán)色)。 紅色球形為CP55940激動(dòng)劑,黃色球形結(jié)構(gòu)為ORG27569。(b)CB1的靜電表面圖。(c)膜的細(xì)胞內(nèi)側(cè)觀察視角


CB1受體中的兩個(gè)芳香環(huán)殘基(F2003.36和W3566.48)構(gòu)象變化決定了受體的激活與否,被稱為該受體的雙撥動(dòng)開(kāi)關(guān)。在具有ORG27569和CP55940的復(fù)合物中,雙撥動(dòng)開(kāi)關(guān)采用的無(wú)效'off'構(gòu)型(圖3a),類似于在taranabant(反向激動(dòng)劑)識(shí)別的結(jié)構(gòu),兩個(gè)殘基形成π-π疏水作用,將受體TM3和TM6鎖定在類似失活的構(gòu)象。與激動(dòng)劑結(jié)構(gòu)(圖3b)和激動(dòng)劑-Gi復(fù)合物(圖3c)形成對(duì)比,其中F2003.36側(cè)鏈從TM5旋轉(zhuǎn)140°并與TM2接觸。這種變化伴隨著另一個(gè)扳動(dòng)開(kāi)關(guān)殘基W3566.48遠(yuǎn)離激動(dòng)劑的運(yùn)動(dòng),伴隨著TM6的向外運(yùn)動(dòng),兩個(gè)殘基間的作用力被破壞,使其受體處于激活構(gòu)象(圖3b,c)??傊谖覀兊难芯恐?,發(fā)現(xiàn)ORG27569和CP55940結(jié)合的CB1三元復(fù)合物處于一種中間構(gòu)象,在該構(gòu)象中,正位口袋在活動(dòng)狀態(tài)下會(huì)收縮以適合激動(dòng)劑(圖3b);然而,撥動(dòng)開(kāi)關(guān)未觸發(fā)(圖3a),阻礙了TM6的移動(dòng)。進(jìn)一步在結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上揭示了別構(gòu)調(diào)節(jié)劑對(duì)CB1受體的調(diào)節(jié)作用。



圖3 CB1受體在不同狀態(tài)下的雙撥動(dòng)開(kāi)關(guān)(F2003.36和W3566.48)(a)CP55940 / ORG27569結(jié)合的CB1和taranabant結(jié)合的CB1的疊加(PDB 5U09)。(b)CP55940 / ORG27569結(jié)合的CB1和AM11542結(jié)合的CB1(PDB 5XRA)的疊加。(c)CP55940 / ORG27569結(jié)合的CB1和Fubinaca / Gibound的CB1(PDB 6N4B)的疊加


最重要的是,我們?cè)谘芯恐邪l(fā)現(xiàn)了一個(gè)全新的GPCR別構(gòu)調(diào)節(jié)位點(diǎn),這與之前發(fā)現(xiàn)的GPCR別構(gòu)調(diào)節(jié)位點(diǎn)不同。ORG27569的氯吲哚基團(tuán)緊靠W2414.50的吲哚側(cè)鏈,而酰胺鍵聯(lián)的哌啶基苯基鏈則延伸穿過(guò)受體外部,緊靠T2424.51和I2454.54(圖4a)。W2414.50殘基是A類GPCR中最保守的殘基之一(圖4c),該位點(diǎn)為GPCR別構(gòu)調(diào)節(jié)位點(diǎn)和藥物設(shè)計(jì)提供了依據(jù)和結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。



圖4 別構(gòu)調(diào)節(jié)劑ORG27569與CB1受體識(shí)別細(xì)節(jié) (a)ORG27569配體(黃色)在4.5?以內(nèi)的接觸殘基(藍(lán)色)。(b)與激動(dòng)劑結(jié)合的CB1(PDB 5XRA)與膽固醇在同一口袋的等效位點(diǎn)。(c)來(lái)自不同A類GPCR的TM4的多序列比對(duì),顯示色氨酸(W)在4.50位保守。(d)在ORG27569結(jié)合位點(diǎn)上,CP55940結(jié)合的CB1(藍(lán)色)、Taranabant結(jié)合的CB1(PDB 5U09,灰色)和Fubinaca結(jié)合的CB1(PDB 6N4B,橙色)的結(jié)構(gòu)重疊


總之,該論文解釋了ORG27569作為CB1受體負(fù)向別構(gòu)調(diào)節(jié)劑的分子機(jī)制,為理解CB1受體的作用機(jī)理打開(kāi)了新的“一扇窗”,同時(shí)為該類受體的新型藥物開(kāi)發(fā)和篩選提供了新的思路。


專家點(diǎn)評(píng)


楊勝勇教授:大麻作為藥用價(jià)值已有幾千年的歷史,主要通過(guò)作用到大麻素受體進(jìn)而調(diào)節(jié)體內(nèi)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,達(dá)到疾病治療的目的。人體內(nèi)源大麻素受體有CB1和CB2兩種。其中, CB1受體主要位于腦、脊髓與外周神經(jīng)系統(tǒng)中,具有GPCR經(jīng)典的7次跨膜螺旋結(jié)構(gòu),被稱中樞型大麻素受體。CB1的激活可以降低神經(jīng)遞質(zhì)的釋放,如多巴胺和GABA,從而調(diào)節(jié)人體的新陳代謝、食欲、疼痛、記憶和學(xué)習(xí)、神經(jīng)系統(tǒng)和心血管系統(tǒng)等諸多方面。因此,CB1受體是疼痛、肥胖、藥物成癮和神經(jīng)退行性等疾病的直接藥物靶標(biāo)。目前針對(duì)該受體的上市藥物主要來(lái)自于植物大麻的天然提取物。相對(duì)于天然產(chǎn)物,目前化學(xué)合成類的CB1靶向藥物副作用較大,高效低毒的藥物發(fā)展較慢,主要原因是CB1受體介導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)非常復(fù)雜,人們尚未完全闡明其調(diào)控機(jī)制,因而限制了創(chuàng)新藥物的研發(fā)。


此前的研究表明CB1具有高度保守的正位結(jié)合口袋,為結(jié)構(gòu)導(dǎo)向的藥物設(shè)計(jì)帶來(lái)了一些困擾,導(dǎo)致傳統(tǒng)藥物具有較低的選擇性和特異性,副作用較高。有趣的是,CB1 受體也被發(fā)現(xiàn)存在別構(gòu)調(diào)節(jié)位點(diǎn),且與激動(dòng)劑配體協(xié)同效應(yīng),更好地調(diào)控信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),也表現(xiàn)出疾病治療的潛力。相比于保守的正位結(jié)合位點(diǎn),GPCR的別構(gòu)調(diào)節(jié)位點(diǎn)具有一定的優(yōu)勢(shì):1.亞型的選擇性和特異性;2. 與正位配體協(xié)同作用調(diào)節(jié)GPCR信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),因此更適合靶向設(shè)計(jì)和發(fā)展藥物。


近期,邵振華研究員與合作者通過(guò)解析CB1受體與負(fù)向別構(gòu)調(diào)節(jié)劑的三維結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)了CB1受體中新的負(fù)向別構(gòu)調(diào)節(jié)劑識(shí)別位點(diǎn),這與之前發(fā)現(xiàn)的GPCR別構(gòu)調(diào)節(jié)位點(diǎn)不同。GPCR家族別構(gòu)調(diào)節(jié)位點(diǎn)的多變性和非保守性的特點(diǎn),為設(shè)計(jì)高選擇性的潛在藥物提供了新的策略,尤其在受體多種亞型間。該論文一方面有助于我們更系統(tǒng)地了解CB1受體的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制;更重要的是,別構(gòu)調(diào)節(jié)劑與激動(dòng)劑的協(xié)同效應(yīng)為CB1受體的藥物開(kāi)發(fā)也提供了新的思路,應(yīng)用前景廣泛。



楊勝勇,博士、四川大學(xué)華西醫(yī)院生物治療國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室教授,教育部長(zhǎng)江學(xué)者、國(guó)家杰出青年科學(xué)基金獲得者、百千萬(wàn)人才工程國(guó)家級(jí)人選、教育部創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)帶頭人。分別于1990年、1993年和1999年在四川大學(xué)獲學(xué)士、碩士和博士學(xué)位。1999-2001年,香港科技大學(xué)化學(xué)系博士后。2002-2005年,加拿大Calgary大學(xué)Research Scientist。2005年10月至今,四川大學(xué)生物治療國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室工作。主要從事小分子靶向藥物研究。至今已在本領(lǐng)域頂級(jí)或重要刊物發(fā)表SCI論文260余篇。申請(qǐng)專利80余項(xiàng),獲授權(quán)專利30余項(xiàng),包括12項(xiàng)國(guó)際專利。研發(fā)的6個(gè)候選新藥已轉(zhuǎn)讓到國(guó)內(nèi)大型制藥公司,其中兩個(gè)已進(jìn)入臨床試驗(yàn)。以第一完成人獲國(guó)家自然科學(xué)二等獎(jiǎng)、教育部自然科學(xué)一等獎(jiǎng)、藥明康德生命化學(xué)研究學(xué)者獎(jiǎng)等。


作者投稿心得


大麻素受體是我們一直研究的對(duì)象,我們?cè)?016年解析了大麻素受體CB1與拮抗劑藥物的晶體結(jié)構(gòu)(Shao Z., et al Nature. 2016),該研究進(jìn)一步拓展了科學(xué)界對(duì)CB1受體的認(rèn)識(shí)。投稿過(guò)程比較順利,在初期,我們是以letter的形式投稿和送審,后來(lái)得到了雜志編輯和審稿人的高度評(píng)價(jià),編輯要求終稿以研究長(zhǎng)文(Articles)的形式發(fā)表,此外,編輯把該論文故事作為雜志封面(cover image)的候選,但沒(méi)有入選。帶著這點(diǎn)小遺憾,同時(shí)作為勉勵(lì),我們課題組將繼續(xù)探索大麻素等受體的作用機(jī)理和藥物開(kāi)發(fā)。


第一作者




邵振華,博士,四川大學(xué)華西醫(yī)院生物治療國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/腎病研究室研究員。研究方向是重要藥物靶標(biāo)G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)的結(jié)構(gòu)藥理學(xué)。GPCR家族是人類中最大的膜蛋白受體家族,是很多藥物的重要靶點(diǎn),目前,約50%的上市藥物直接作用于GPCR。課題組綜合運(yùn)用冷凍電鏡技術(shù)(Cryo-EM)、X-射線晶體學(xué)、及藥理學(xué)等技術(shù)手段研究GPCR的結(jié)構(gòu)與藥物開(kāi)發(fā),為疾病治療提供新思路。近年來(lái)先后在Nature、Nature Chemical Biology等國(guó)際高水平學(xué)術(shù)期刊發(fā)表論文。目前承擔(dān)了科技部重點(diǎn)專項(xiàng)“蛋白質(zhì)機(jī)器與生命過(guò)程調(diào)控”及國(guó)家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目,并入選國(guó)家“千人計(jì)劃”青年項(xiàng)目、四川省“千人計(jì)劃”青年項(xiàng)目。

Email:zhenhuashao@scu.edu.cn



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本文編輯:汪文靜

本文排版:陳紅梅 張洪雪

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