目的 了解SARS期間各主要信息源發(fā)布信息的時效性、科學性及成效,為健全我國公共衛(wèi)生及信息體系的信息收集、識別和發(fā)布系統(tǒng)提供決策參考.方法 系統(tǒng)收集2003年全年SARS的各種相關信息,來源于Medline、CBMdisc和Cochrane圖書館光盤數(shù)據(jù)庫;WHO、中國衛(wèi)生部和美國CDC等官方網(wǎng)站;新浪、搜狐、雅虎(中國)等民間網(wǎng)站;11種中文雜志和其他灰色文獻,并根據(jù)信息的科學性將證據(jù)分級,結合時效性進行分析.結果 共收集相關信息11 955條.民間網(wǎng)站信息量最大(占46.7%);信息的科學性按手檢雜志、Medline、灰色文獻、CBMdisc、官方網(wǎng)站和民間網(wǎng)站遞降;時效性按官方網(wǎng)站、民間網(wǎng)站、雜志和數(shù)據(jù)庫遞減.官方網(wǎng)站和數(shù)據(jù)庫中的中文信息分別占71.8%和65%.結論 中國SARS信息對全球SARS信息發(fā)布的貢獻突出,信息量和時效性均佳,但信息管制和深度加工還需加強.
目的進一步了解甲狀腺乳頭狀癌（papillary thyroid carcinoma，PTC）發(fā)生發(fā)展的生物分子機制，尋找新的臨床病理特征判斷依據(jù)以及預后評價和靶向治療的新分子靶點。方法通過分析基因表達綜合數(shù)據(jù)庫（GEO）中相關樣本的基因芯片數(shù)據(jù)，篩選出 PTC 與正常甲狀腺組織細胞中的差異表達基因（the differentially expressed genes，DEGs）。運用 STRING 及 DAVID 在線數(shù)據(jù)庫對 DEGs 進行蛋白互作 （the protein-protein interaction，PPI ）網(wǎng)絡分析、GO 功能和生物學途徑富集通路分析以及 KEGG 代謝通路分析，并從中篩選出關鍵基因。結果本研究共篩選出 339 個 DEGs 及 10 個關鍵基因，其中 FN1、CCND1、TIMP1、ICAM1、APOE、MET、RUNX2、KRT19 和 SERPINA1 在 PTC 中的表達上調，KIT 在 PTC 中的表達下調。在對假設檢驗做多重檢驗校正后，可得 APOE ［錯誤發(fā)現(xiàn)率 （false discover rate，F(xiàn)DR）=0.047 5］ 及 KIT（FDR=0.042 0）基因表達的改變對 PTC 患者的無復發(fā)生存期（recurrence-free-survival，RFS） 有一定的影響，具有統(tǒng)計學意義。結論FN1、ICAM1、APOE、MET、KRT19、KIT 和 SERPINA1 基因相對高表達的改變可能與 PTC 的預后有關。但需要進一步的研究來具體闡明這些基因在 PTC 發(fā)生發(fā)展過程中的生物作用機制。
目的 應用生物信息學方法探究POLD1基因在非小細胞肺癌（non-small cell lung cancer，NSCLC）中的表達及臨床意義。方法 應用TIMER數(shù)據(jù)庫分析POLD1在NSCLC及正常肺組織中的表達差異，UALCAN數(shù)據(jù)庫進一步驗證并分析POLD1在不同臨床亞組間的表達。利用GEPIA、TIMER數(shù)據(jù)庫探索POLD1表達水平與NSCLC患者預后的關系， cBioPortal、STRING數(shù)據(jù)庫研究POLD1在NSCLC中突變及蛋白相互作用，TISIDB數(shù)據(jù)庫探索POLD1表達與NSCLC腫瘤免疫浸潤的關系。結果 POLD1在肺腺癌及肺鱗癌組織中表達均高于正常組織。POLD1低表達的肺腺癌患者較高表達患者預后更好，POLD1與肺鱗癌患者預后無明顯相關性。突變分析發(fā)現(xiàn)1.2%的肺腺癌患者及1.8%的肺鱗癌患者攜帶POLD1突變，主要為錯義突變。蛋白互作分析發(fā)現(xiàn)POLD1可能與POLD2、POLD3、POLD4、POLE、RPA1、PCNA、MSH6、MSH2、FEN1蛋白有相互作用，功能集中于DNA復制、錯配修復等。此外，POLD1與NSCLC組織中免疫細胞浸潤相關。結論 POLD1在NSCLC中高表達，其表達與肺腺癌生存預后呈負相關。POLD1基因可能成為NSCLC早期診斷、預后判斷及免疫療效標志物。