隨著結(jié)核病防治研究的不斷深入, 人們發(fā)現(xiàn)細(xì)胞水平時(shí)代結(jié)核病流行病學(xué)的兩大問題———傳播途徑和傳染源, 是了解得不夠確切、不夠深刻的, 從傳染與發(fā)病的關(guān)系上鑒定外源性再感染, 用噬菌體分型毫無實(shí)際價(jià)值。而常規(guī)細(xì)菌培養(yǎng)法進(jìn)行耐藥性監(jiān)測作為流行病學(xué)調(diào)查方式之一, 只能了解其耐藥的表型狀況, 難以探討其內(nèi)在機(jī)制。隨著分子生物學(xué)的飛速發(fā)展, 1980 年以后, 逐步建立了一些根據(jù)核酸序列進(jìn)行菌株鑒定的高度特異的基因分型方法, 主要包括: 限制性片段長度多態(tài)性、DNA 指紋圖譜分析、脈沖場凝膠電泳、PCR酶切分型、隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA、DNA 序列分析以及基因芯片技術(shù)等等。結(jié)合現(xiàn)代分子生物信息學(xué)技術(shù), 使結(jié)核分枝桿菌的菌株分型進(jìn)入了一個(gè)全新的領(lǐng)域———株水平的鑒定, 也進(jìn)而使結(jié)核病分子流行病學(xué)的研究取得了很大的進(jìn)展。許多研究者在結(jié)核病的流行病學(xué)研究中, 把群體研究與個(gè)體研究、宏觀研究與微觀研究結(jié)合起來, 研究結(jié)核分枝桿菌( Mycobacteriumtuberculosis,MTB) 的分子結(jié)構(gòu)上的差異, 結(jié)合病例流行病學(xué)資料, 以闡明結(jié)核病的流行病學(xué)問題, 形成了結(jié)核病分子流行病學(xué)。分子分型技術(shù)是結(jié)核病分子流行病學(xué)研究的重要手段之一。對(duì)受感染個(gè)體的菌株進(jìn)行分子分型在追蹤傳染源方面起重要作用。
目的 總結(jié)乳腺癌干細(xì)胞與基因分型的研究進(jìn)展,并分析二者之間的相關(guān)性。方法 分析近年來有關(guān)乳腺癌干細(xì)胞與基因分型研究的文獻(xiàn)報(bào)道。結(jié)果 乳腺癌干細(xì)胞與基因分型的相關(guān)性研究支持了乳腺癌的腫瘤干細(xì)胞起源學(xué)說,解釋了乳腺癌基因分型的復(fù)雜性及其異質(zhì)性。結(jié)論 乳腺癌干細(xì)胞和基因分型的相關(guān)性研究能為從細(xì)胞分子水平研究乳腺癌的形成機(jī)理和生物學(xué)特性找到新的途徑,有望為乳腺癌的診斷和治療提供新的策略與手段。
目的 對(duì)四川大學(xué)華西醫(yī)院的丙型肝炎患者 HCV 病毒基因分型特點(diǎn)進(jìn)行分析，探討 HCV 主要基因型與臨床特征。 方法 納入 2011 年 3 月～2016 年 9 月就診于四川大學(xué)華西醫(yī)院 HCV 基因分型成功的 4 520 例 HCV 患者，對(duì) HCV 基因型和主要基因型患者的肝功能、基線病毒載量進(jìn)行分析，探討 HCV 基因型在肝癌、肝硬化和 HBV/HCV 復(fù)合感染患者的分布情況。 結(jié)果 納入患者的 HCV 基因型分為 1、2、3、4、6 五種基因型及 23 種亞型，基因型/亞型以 1b、1*、3b、2a、3a、6a 為主，分別占 66.42%、8.01%、6.57%、4.54%、4.29%、3.41%。男性和女性中均以 1b 型為主，分別占 29.89% 和 36.53%。HCV 主要基因型/亞型在門（急）診患者與住院患者中分布相似。HCV 主要基因型/亞型在不同年齡段均以 1b 型占優(yōu)。在男性中，6a 亞型的 ALT 值最高；在女性中，3a 亞型的 ALT 值最高。納入的 94 例肝硬化患者中，1b 型最高 為42 例；6 例肝癌患者中，僅有 1b 和 3b 型檢出。HCV 和 HBV 雙重感染患者共 53 例，基因型3a占比最高，共 12 例。 結(jié)論 四川大學(xué)華西醫(yī)院就診 HCV 患者 HCV 基因型/亞型具有獨(dú)特的分布特點(diǎn)，以1b、1*、3b、2a、3a、6a 為主。
目的探討腫瘤壞死因子（TNF）-α 基因多態(tài)性與黑龍江省東部地區(qū)慢性阻塞性肺疾病（簡稱慢阻肺）人群易感性的相關(guān)性。方法選取 2016 年 1 月至 2017 年 1 月在佳木斯大學(xué)附屬第一醫(yī)院呼吸內(nèi)科住院、門診確診的慢阻肺患者 347 例為病例組，同期本院體檢中心的健康體檢人群 338 例作為對(duì)照組。提取全血 DNA，通過高分辨熔解曲線突變檢測系統(tǒng) HRM 及基因測序的方法檢測基因型，比較兩組基因表型及等位基因概率并進(jìn)行 SHEsis 遺傳不平衡單倍型分析。結(jié)果TNF-α –308G/A 共顯性模型和隱性模型在兩組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（共顯性 P=0.036，OR 1.512，95%CI 1.023～2.234）；隱性 P=0.027，OR 1.202，95%CI 1.024～1.741）。–850G/A 共顯性模型、顯性模型和超顯性模型在兩組間差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（共顯性 P=0.000，OR 1.781，95%CI 1.363～2.329；顯性 P=0.000，OR 0.391 7，95%CI 1.363～2.329；超顯性 P=0.000，OR 2.680，95%CI 1.728～4.156）］。單倍體分析及單倍體基因型分析結(jié)果顯示 +489、–308、–850 位點(diǎn)分別為 A、G、A 時(shí)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P<0.05，OR>1，95%CI>1）。病例組中按照肺功能分級(jí)相比較，–308G/A、–863C/A 位點(diǎn)突變基因組與野生型基因組肺功能差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P=0.038，P=0.020）。結(jié)論在黑龍江省東部地區(qū)人群中，TNF-α –308 位點(diǎn)上 A、–850 位點(diǎn)上 G 等位基因可能是慢阻肺的危險(xiǎn)因素，且純合子發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)較高。當(dāng) +489、–308、–850 分別為 A、G、A 時(shí)可能是慢阻肺的危險(xiǎn)因素，此三位點(diǎn)基因型為 AGA 的患者發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)較高。TNF-α –308 中 A 等位基因、–863 中 A 等位基因與慢阻肺肺功能惡化有關(guān)，此二位點(diǎn)含 A 等位基因的慢阻肺患者肺功能下降速率更高、更易惡化。
目的探討四川大學(xué)華西醫(yī)院乙型肝炎病毒（hepatitis B virus，HBV）基因型分布特征和耐藥突變情況，為乙型肝炎個(gè)體化治療提供依據(jù)。方法選擇 2016 年 1 月—2018 年 12 月于四川大學(xué)華西醫(yī)院就診的 786 例慢性乙型肝炎患者為研究對(duì)象，通過 Sanger 測序法測序并分析基因型和耐藥突變，應(yīng)用 χ2 檢驗(yàn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。結(jié)果786 例樣本中共檢出 B、C、D 3 種基因型，B 基因型 489 例（62.2%），C 基因型 291 例（37.0%），D 基因型 6 例（0.8%），B、C 基因型在不同年齡和民族中的分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P<0.05）；627 例發(fā)生耐藥突變，耐藥突變率為 79.8%，對(duì)拉米夫定+替比夫定耐藥的病例數(shù)最多，有 262 例（33.3%），102 例（13.0%）對(duì)拉米夫定+替比夫定+恩替卡韋均耐藥，83 例（10.6%）對(duì)阿德福韋酯耐藥，該樣本群體中未發(fā)現(xiàn)替諾福韋耐藥株，B、C 基因型中不同藥物耐藥株之間的數(shù)量差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（χ2=14.356，P<0.01）；最常見的單點(diǎn)耐藥突變是 M204I，共 179 例（22.8%），其次是與阿德福韋酯耐藥相關(guān)的 A181V/T 有 46 例（5.9%）；混合耐藥突變最常見的是 L180M+M204V/I，共 83 例（10.6%），另檢出 102 例（13.0%）在 L180M+M204V/I 的基礎(chǔ)上出現(xiàn)了 M250V、V173L、T184A/G/S/I、S202G/I。結(jié)論四川大學(xué)華西醫(yī)院的 HBV 基因型以 B 型和 C 型為主，且耐藥形勢嚴(yán)峻，突變模式復(fù)雜，應(yīng)及時(shí)檢測 HBV 基因型和耐藥突變，從而制定更好的臨床治療方案。
目的探討成人肝移植供受體 CYP3A5 基因分型與術(shù)后他克莫司藥物代謝的關(guān)系。方法回顧性收集天津市第一中心醫(yī)院 2018 年 7 月至 2019 年 6 月期間施行的肝移植的供受體各 98 例為研究對(duì)象，術(shù)前收集肝移植受體和供體血，通過 PCR 法檢測供受體的 CYP3A5 基因型，并收集術(shù)后 1、2、3 及 4 周的他克莫司濃度/劑量比。結(jié)果在 98 例肝移植供受體的 CYP3A5 基因分型中，均以 GG 型最多、AA 型最少，且等位基因分布符合遺傳規(guī)律，差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P>0.05）。術(shù)后 1、2、3 及 4 周時(shí)，不管是在供體還是在受體中，3 種基因型組的他克莫司濃度/劑量比兩兩比較差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P<0.05），GG 型最高，AA 型最低。聯(lián)合供體和受體的基因型進(jìn)行聯(lián)合分組分析，結(jié)果表明，術(shù)后 1、2、3 及 4 周時(shí)，A*/A*、A*/GG、GG/A* 和 GG/GG 組的他克莫司濃度/劑量比兩兩比較差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P<0.05），GG/GG 型最高，A*/A*型最低。結(jié)論供受體的 CYP3A5 基因分型可以影響受體肝移植術(shù)后他克莫司的血藥濃度，CYP3A5 GG 基因型比其他基因型更容易達(dá)到目標(biāo)血藥濃度，檢測肝移植患者供受體 CYP3A5 基因型可以為受體肝移植術(shù)后他克莫司的個(gè)體化治療提供參考。
結(jié)核分枝桿菌是人類結(jié)核病的病原體。通過測定結(jié)核分枝桿菌基因分型，能及時(shí)發(fā)現(xiàn)結(jié)核病的疫情流行特點(diǎn)，分析不同轄區(qū)患者之間的傳播鏈條，從而及時(shí)制定有效的干預(yù)措施，為臨床的診斷和治療提供有力的依據(jù)。目前，結(jié)核分枝桿菌基因分型的幾種技術(shù)在應(yīng)用上各有利弊，該文就結(jié)核分枝桿菌的基因分型技術(shù)、群體遺傳學(xué)和基因分型命名規(guī)則進(jìn)行了綜述。