目的 探討HBsAg陽性肝細(xì)胞肝癌（HCC）患者乙型肝炎病毒（HBV）DNA基因型與其患HCC之間的關(guān)系。方法 運(yùn)用PCR條帶分析與基因測(cè)序相結(jié)合的方法對(duì)我院500例HBsAg陽性患者（其中HCC患者150例）的HBV DNA進(jìn)行分型，并對(duì)分型結(jié)果進(jìn)行分析。結(jié)果 HBV DNA B型和C型基因型是HBsAg陽性HCC患者和非HCC患者的共同優(yōu)勢(shì)基因型，但HCC患者中C型基因型所占比例為65.33%（98/150），明顯高于非HCC患者的25.14%（88/350），而B型則相反，分別為28.67%（43/150）與68.86%（241/350），χ2=75.45，Plt;0.05。HCC患者中，HBV的B型與C型基因型分布在不同性別及不同年齡段之間的差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（Pgt;0.05）。結(jié)論 HBV DNA C型基因型在HCC患者中多見，可能與HCC的發(fā)生有關(guān)。
目的 探討引起醫(yī)院獲得性肺炎( HAP) 的耐甲氧西林金黃色葡萄球菌( MRSA) 的基因多態(tài)性。方法 2007 年1 月至2008 年1 月上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院住院診斷為醫(yī)院獲得性MRSA 肺炎患者74 例, 對(duì)所得82 株菌株進(jìn)行隨機(jī)擴(kuò)增DNA 的多態(tài)性( RAPD) 基因分型。結(jié)果 82 株MRSA經(jīng)電泳得到2 ～15 條片段, 經(jīng)聚類分析可分為11 個(gè)基因型。從重癥監(jiān)護(hù)室( ICU) 病例中分離所得的菌株, 主要為Ⅲ、Ⅵ型和Ⅶ型( 32. 56% 、30. 23% 和13. 95% ) 。從老年科、急診科和呼吸科病例中分離所得的菌株, 除有各自相對(duì)獨(dú)立的基因型外, 同時(shí)還有與ICU所得菌株重疊的基因型存在。其余臨床科室病例所分離的MRSA 菌株數(shù)量較少, 分布也較分散與獨(dú)立。暴發(fā)和聚集性病例共占48. 65% ( 36/ 74) , 所有暴發(fā)病例均發(fā)生于ICU 病區(qū)內(nèi)。結(jié)論 院內(nèi)獲得性MRSA 肺炎易于播散,特別是在ICU可發(fā)生小范圍的暴發(fā)。隨機(jī)擴(kuò)增DNA 的多態(tài)性分型對(duì)及早識(shí)別高?；颊摺㈩A(yù)防MRSA在院內(nèi)的播散具有價(jià)值。
目的 尋找趨化素樣因子( CKLF) 基因上游啟動(dòng)子區(qū)的單核苷酸多態(tài)性( SNP) , 明確其與支氣管哮喘發(fā)病的相關(guān)性。方法 提取245 例北京地區(qū)漢族人( 其中哮喘患者119 例, 健康對(duì)照126 例) 基因組DNA, 采用PCR 方法擴(kuò)增CKLF 上游啟動(dòng)子區(qū)1553 堿基的DNA 片段并進(jìn)行直接測(cè)序, 分析發(fā)現(xiàn)的SNPs 的等位基因頻率、基因型頻率和單倍型分布頻率及其與哮喘的發(fā)病和臨床表現(xiàn)的相關(guān)性。結(jié)果 在CKLF 上游啟動(dòng)子區(qū)共發(fā)現(xiàn)4 個(gè)SNPs: SNP88( T gt; C) 、SNP196( T gt; C) 、SNP568( Cgt;G) 、SNP1047( C gt; G) 。其等位基因頻率分別為0. 168 ( SNP88C) 、0. 168 ( SNP196C) 、0. 352( SNP568G) 和0. 167( SNP1047G) , 與以往報(bào)道的其他種族的結(jié)果明顯不同。SNP88 與SNP196 之間、SNP88 與SNP1047 之間, 以及SNP196 與SNP1047 之間存在完全連鎖不平衡( D′= 1. 000, r2 = 1. 000) ,SNP568 與SNP88、SNP196 及SNP1047 間存在連鎖不平衡( r2 = 0. 366) 。哮喘組與對(duì)照組4 個(gè)SNPs 的等位基因頻率、基因型頻率和單倍型頻率差異無顯著性。結(jié)論 北京地區(qū)漢族人群CKLF 編碼基因上游調(diào)控區(qū)的基因多態(tài)性有其獨(dú)特的分布特點(diǎn)及連鎖不平衡特征, 雖然與哮喘的發(fā)病無明顯相關(guān)性, 但其分布特點(diǎn)可能為其他疾病相關(guān)性研究提供有價(jià)值的資料。
【摘要】 目的 研究在漢族人群中, 線粒體DNA ( mtDNA) 的單倍群M中mt5351G 和mt6680C基因型與高原肺水腫( HAPE) 易感的相關(guān)性。方法 收集漢族HAPE 患者標(biāo)本206 例, 以及與其匹配的漢族健康對(duì)照標(biāo)本144 例。采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性片段長度多態(tài)性( PCR-RFLP) 的方法確定mtDNA 的單倍群M和N, 通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-高溫連接酶檢測(cè)反應(yīng)( PCR-LDR) 的方法研究在mtDNA 單倍群M中mt5351G、mt6680C 基因型與HAPE 易感的相關(guān)性。結(jié)果 mtDNA 單倍群M和N在HAPE 病例組的頻率分別為49. 0% 和51. 0% , 在對(duì)照組中的頻率分別為47. 2% 和52. 8% , 兩組mtDNA 單倍群M和N的頻率無顯著差異( P gt;0. 05) 。在mtDNA 單倍群M中, mt5351G 和mt6680C基因型在HAPE 病例組頻率顯著高于其在對(duì)照組中的頻率( 均為12. 0% 比1. 5% , P =0. 016) 。結(jié)論 在單倍群M中mt5351G 和mt 6680C 基因型是漢族人群HAPE 發(fā)病的危險(xiǎn)因素, 是漢族人群HAPE 易感的遺傳標(biāo)記之一。
目的 了解中國5 個(gè)地區(qū)亞胺培南耐藥的銅綠假單胞菌部分氨基糖苷類修飾酶分布情況。方法 從成都、杭州、北京、上海和廣州收集對(duì)亞胺培南耐藥的銅綠假單胞菌, 使用PCR 法擴(kuò)增16 種氨基糖苷類修飾酶基因。結(jié)果 共收集了146 株亞胺培南耐藥的銅綠假單胞菌。16 種氨基糖苷類修飾酶基因中有6 種基因型獲得陽性的PCR 結(jié)果, 氨基糖苷類修飾酶基因總檢出率為 65. 06% , 各種氨基糖苷類修飾酶基因檢出率分別為aac( 3) -Ⅱ33. 6% 、aac( 6′) -Ⅰ15. 8% 、aac( 6′) -Ⅱ 19. 9%、ant( 2″) -Ⅰ28. 8% 、ant( 3″) -Ⅰ14. 4% 和aph( 3′) -Ⅵ4. 8% 。氨基糖苷類修飾酶基因的分布存在地區(qū)差異, 其中杭州和上海6 種AMEs 基因均被檢測(cè)出, 成都和北京檢測(cè)出4 種AMEs 基因, 廣州的IRPA 中僅檢測(cè)出3 種AMEs 基因。結(jié)論 亞胺培南耐藥的銅綠假單胞菌氨基糖苷類修飾酶基因攜帶率高; 氨基糖苷類修飾酶基因型在中國5 個(gè)地區(qū)間分布存在差異。
目的 選育豬到人異種移植的供器官豬種和醫(yī)藥實(shí)驗(yàn)研究大動(dòng)物用豬種，首先應(yīng)篩查其是否易患豬應(yīng)激綜合征(PSS)。方法 采用聚合酶鏈反應(yīng)結(jié)合限制性內(nèi)切酶技術(shù)(PCR-RFLP)研究版納小耳豬近交系(BMI)和近交培育之中的五指山豬(WZSP)的氟烷基因型，篩查其是否有易患豬應(yīng)激綜合征的可能。結(jié)果 50頭版納小耳豬近交系和15頭五指山豬氟烷基因型均為陰性純合子。結(jié)論 這兩種豬種可望成為豬到人異種移植和醫(yī)藥實(shí)驗(yàn)研究的理想動(dòng)物。
丙型肝炎病毒感染后大多數(shù)患者轉(zhuǎn)為慢性感染，若不及時(shí)正確地進(jìn)行治療，相當(dāng)比例患者會(huì)產(chǎn)生嚴(yán)重臨床后果，丙型肝炎患者一旦確診應(yīng)積極行抗病毒治療。根據(jù)病毒基因型及患者治療過程中病毒學(xué)應(yīng)答情況來預(yù)測(cè)療效并相應(yīng)調(diào)整治療方案，成為目前抗病毒治療的研究熱點(diǎn)。
【摘要】 目的 對(duì)四川人群的13個(gè)短串聯(lián)重復(fù)(short tandem repeat,STR)基因座進(jìn)行遺傳多態(tài)性調(diào)查。方法 310份血樣采自四川地區(qū)無血緣關(guān)系個(gè)體。Chelex法提取DNA,PCR復(fù)合擴(kuò)增,自動(dòng)基因分析儀電泳收集電泳結(jié)果數(shù)據(jù),基因分型軟件進(jìn)行樣本基因型分型。結(jié)果 13個(gè)STR基因座的基因型分布符合HardyWeinberg平衡。累計(jì)非父排除率和累計(jì)個(gè)人識(shí)別率為0.999 991 728和gt;0.999 999 999。結(jié)論 上述13個(gè)STR基因座的累計(jì)非父排除率和累計(jì)個(gè)人識(shí)別率較高,適合作為四川人群的遺傳標(biāo)記,用于法醫(yī)學(xué)親權(quán)鑒定和個(gè)體識(shí)別等領(lǐng)域的研究。
目的 總結(jié)CYP3A5在肝移植術(shù)后他克莫司個(gè)體化治療中的意義。方法 復(fù)習(xí)、分析近年來有關(guān)肝移植患者CYP3A5基因多態(tài)性對(duì)他克莫司藥代動(dòng)力學(xué)影響的文獻(xiàn)。結(jié)果 他克莫司可以有效預(yù)防肝移植的排斥反應(yīng)。藥代動(dòng)力學(xué)中狹窄的有效藥物濃度范圍和個(gè)體差異使其很難確定針對(duì)所有患者的固定劑量，藥物代謝酶和轉(zhuǎn)運(yùn)子的基因多態(tài)性影響著他克莫司的血藥濃度。CYP3A5基因分型影響著肝移植受體的他克莫司需要量。結(jié)論 CYP3A5基因分型可能為優(yōu)化肝移植患者的免疫抑制治療提供幫助。
目的 研究慢性阻塞性肺疾病急性加重( AECOPD) 患者中不同基因型副流感嗜血桿菌( HPI) 的分布及其對(duì)氣道上皮細(xì)胞株A549 的影響。方法 以2010 年至2011 年間中山大學(xué)附屬第三醫(yī)院住院的AECOPD 患者為研究對(duì)象, 采集痰標(biāo)本培養(yǎng)HPI, 所得菌株采用隨機(jī)引物聚合酶鏈反應(yīng)( RAPD) 進(jìn)行基因分型, 并與氣道上皮細(xì)胞株A549 共同培養(yǎng), 作用不同時(shí)間后取細(xì)胞培養(yǎng)上清行白細(xì)胞介素6( IL-6) 、IL-8 的檢測(cè), 并通過顯微鏡觀察細(xì)胞形態(tài)變化。結(jié)果 入組80 例AECOPD 患者, 按癥狀分為3 型, 共培養(yǎng)HPI 15 株, 培養(yǎng)陽性率18.8% 。1 型與3 型兩組間細(xì)菌陽性率比較有顯著差異。所得菌株與A549 上皮細(xì)胞共培養(yǎng)后IL-8、IL-6 分泌水平均較對(duì)照組明顯升高, 且與時(shí)間呈正相關(guān)。所得菌株采用RAPD 法可分為4 種基因型, RAPD Ⅲ型與A549 上皮細(xì)胞共培養(yǎng)后, 12 h 和 24 h 的IL-8 分泌水平均高出其他組。各組經(jīng)顯微鏡觀察均未見明顯細(xì)胞形態(tài)學(xué)變化, 且HPI 未進(jìn)入細(xì)胞。結(jié)論 不同臨床類型AECOPD 患者痰HPI 培養(yǎng)陽性率不同。HPI 無法進(jìn)入氣道上皮細(xì)胞胞內(nèi), 可能是胞外感染菌, 但能夠引起氣道上皮細(xì)胞炎癥因子表達(dá)持續(xù)升高, 而且不同基因型毒力不同。 HPI 可能是COPD 急性加重的致病菌之一。